21个国家377个全基因组分析探究新冠病

日前,Nature制作了5张新冠病毒可视化图表,直观展示疫情变化趋势、科研人员发文速度等。西电李雁妮教授和北大刘兵教授等学者联合发表了一篇关于新冠病毒全基因序列相似性的研究,涉及21个国家的个COVID-19及相关病毒的全基因序列,离病毒溯源更进一步。

日前,Nature制作了关于这次新冠病毒疫情的五张图表,以一种非常直观的方式为我们呈现了病毒确诊病例的变化趋势、R0值对比、科研人员发布研究的速度、旅行限制对碳排放和空气质量的影响、以及和年SARS相比的大流行情况等。

Nature可视化图表:新冠病毒与SARS时间表对比,这次中国真速度

目前,全球已经有超24万人感染新冠肺炎,中国境外确诊已超过境内确诊病例。第一张图展示了中国和其他国家确诊病例的变化趋势,2月中旬后中国确诊数放缓,其他国家3月开始陡增。

第二张图展示了COVID-19与其他疾病R0值和致死率的对比。目前对COVID-19病死率的估计表明,新冠病毒的致死率低于其他大规模疫情的病原体,如SARS、MERS和埃博拉。但是这种感染似乎比季节性流感等其他疾病更容易传播。新冠病毒的基本繁殖数R0值约2到2.5。

第三张图展示了旅行限制对碳排放和空气质量的影响。中国为控制疫情所做的努力似乎已经遏制了能源消耗和空气污染。NASA和欧洲航天局收集的卫星数据显示,全国范围内大气中二氧化氮(NO2,是化石燃料燃烧过程中产生的)含量急剧下降。初步分析表明,农历新年后的NO2污染比往年同期减少了10–30%。

第四张图是新冠病毒与SARS时间表对比。SARS疫情持续了三个月后才被确认为是一种独特的疾病。然后,在接下来将近两个月的时间里,还在寻找病原体:病毒本身的鉴定和基因组测序主要来自中国以外的研究人员。

相比之下,在第一个已知的COVID-19病例发生三周后,中国已经通知世卫组织,出现了类似肺炎的病例激增。两周后,这种冠状病毒被分离出来,进行了基因测序,并开发出了一种诊断测试,为中国提供了所需的工具,并启动了全球有史以来最大规模的传染病遏制行动之一。

最后一张图展示了新冠病毒相关研究随时间的变化。这次疫情的爆发促进了对新冠病毒及其引起的疾病的大规模研究。截至3月12日,有关新冠病毒的论文、预印本和初步报告约有篇。

接下来我们就和大家分享一个关于新冠病毒的新研究。

21个国家的个全基因组序列,探究COVID-19病毒之间的相似性和进化关系

西安电子科技大学教授李雁妮等人和北京大学讲席教授刘兵发表了一篇关于新冠病毒全基因序列相似性的研究,题为“SimilaritiesandEvolutionaryRelationshipsofCOVID-19andRelatedViruses”(COVID-19与相关病毒的相似性及其进化关系)。

论文


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